22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2861 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2861  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  310  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.663147  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0557  hypothetical protein  53.64 
 
 
176 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2340  hypothetical protein  48.3 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2560  hypothetical protein  46.79 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0812  hypothetical protein  46.79 
 
 
186 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1986  hypothetical protein  44.74 
 
 
194 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2616  hypothetical protein  45.1 
 
 
185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  41.79 
 
 
412 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1457  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0014  hypothetical cytosolic protein  44.08 
 
 
196 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1167  hypothetical protein  46.79 
 
 
358 aa  93.2  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000105813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1212  hypothetical protein  47.12 
 
 
339 aa  92.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000149862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0125  hypothetical protein  43.36 
 
 
205 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2646  hypothetical protein  37.82 
 
 
170 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.887278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4890  hypothetical protein  47.92 
 
 
254 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0596  hypothetical protein  36.84 
 
 
293 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3664  hypothetical protein  46.81 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0364  hypothetical protein  37.23 
 
 
264 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2562  hypothetical protein  65 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13830  ORF6N domain-containing protein  42.25 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1220  hypothetical protein  36.23 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4388  hypothetical protein  44.68 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>