More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0615 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  83.15 
 
 		 89 aa  150  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  80.9 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  78.65 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  76.4 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  74.16 
 
 		 89 aa  140  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  74.16 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  71.91 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  73.03 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  71.91 
 
 		 89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  71.91 
 
 		 89 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  64.04 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  65.17 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  64.04 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  64.04 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  62.92 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  53.68 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  52.48 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  55 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  54.74 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4230  30S ribosomal protein S14  52.69 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  93.6  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3896  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000012312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  93.2  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  51.69 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  52 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  49.5 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4736  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000804532  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0497  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0467  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00078968  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0500  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000825135  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  50 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>