45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3966 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  100 
 
 		 78 aa  159  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  84.42 
 
 		 92 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  79.49 
 
 		 78 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  81.82 
 
 		 79 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  78.21 
 
 		 79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  79.22 
 
 		 79 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  79.22 
 
 		 79 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  76.62 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  73.08 
 
 		 80 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  69.23 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  78.18 
 
 		 58 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  51.32 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  50.67 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  49.3 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  45.07 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  45.71 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  45.07 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  47.89 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  43.28 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  40.26 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3715  glutaredoxin 2  44.64 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0820136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  40.28 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1148  glutaredoxin 2  40.35 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  44.29 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  38.03 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  36.11 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  44.29 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  42.86 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  42.25 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  42.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  38.89 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  41.54 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  40 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  33.73 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4204  glutaredoxin 2  33.87 
 
 		 95 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1485  hypothetical protein  37.1 
 
 		 88 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4094  glutaredoxin 2  37.04 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02011  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin i  39.53 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0686532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  41.43 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>