More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0024 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  79.22 
 
 
521 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  69.6 
 
 
546 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  80.5 
 
 
522 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  80.12 
 
 
522 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  100 
 
 
522 aa  1024    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  78.64 
 
 
521 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  78.83 
 
 
521 aa  698    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  76.97 
 
 
521 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  58.53 
 
 
517 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  59.06 
 
 
517 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  43.55 
 
 
626 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  43.71 
 
 
577 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  40.19 
 
 
603 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  40.48 
 
 
584 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  40.98 
 
 
620 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  40 
 
 
608 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  40.49 
 
 
603 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  39.8 
 
 
711 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  38.64 
 
 
599 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  37.31 
 
 
730 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  32.37 
 
 
580 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  37.63 
 
 
620 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  33.15 
 
 
573 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  35.74 
 
 
703 aa  274  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  37.62 
 
 
590 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  39.96 
 
 
711 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  35.75 
 
 
588 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  36.59 
 
 
729 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  42.38 
 
 
698 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.44 
 
 
588 aa  246  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  38.26 
 
 
601 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  34.23 
 
 
703 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  36.35 
 
 
584 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.53 
 
 
591 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  31.25 
 
 
585 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.66 
 
 
578 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  31.02 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  37.15 
 
 
558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.69 
 
 
605 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.43 
 
 
605 aa  217  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  30.95 
 
 
575 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  37.15 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.18 
 
 
583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.88 
 
 
585 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  29.96 
 
 
574 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.52 
 
 
574 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.95 
 
 
590 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  27.37 
 
 
571 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.37 
 
 
572 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  31.68 
 
 
586 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  33.4 
 
 
604 aa  204  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.5 
 
 
577 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  30.31 
 
 
592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.74 
 
 
579 aa  193  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  33.8 
 
 
573 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.86 
 
 
570 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.43 
 
 
570 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  30.77 
 
 
549 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  27.98 
 
 
568 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  30.16 
 
 
592 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  25 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  28.17 
 
 
585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  30.57 
 
 
555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  28.28 
 
 
567 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  28.38 
 
 
585 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  31.4 
 
 
586 aa  183  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.87 
 
 
581 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  27.4 
 
 
550 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  29.69 
 
 
563 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  30.05 
 
 
572 aa  182  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  32.25 
 
 
564 aa  182  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  28.64 
 
 
585 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  28.88 
 
 
581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  29.03 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  28.41 
 
 
567 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  27.18 
 
 
568 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  28.05 
 
 
590 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  28.96 
 
 
551 aa  180  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  28.36 
 
 
583 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  32.12 
 
 
544 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  28.15 
 
 
585 aa  180  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  27.7 
 
 
585 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  27.7 
 
 
585 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  27.7 
 
 
585 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  27.7 
 
 
585 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  25.93 
 
 
552 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  31.98 
 
 
545 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  28.41 
 
 
574 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  32.02 
 
 
632 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  24.37 
 
 
587 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  33.64 
 
 
571 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  25.57 
 
 
569 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  25.57 
 
 
569 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  29.63 
 
 
588 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  28.39 
 
 
578 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  27.34 
 
 
545 aa  176  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  28.97 
 
 
570 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  42.59 
 
 
694 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  26.25 
 
 
568 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  25.82 
 
 
552 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>