More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2773 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 
242 aa  487  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  92.12 
 
 
258 aa  427  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  64.83 
 
 
256 aa  298  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  60 
 
 
251 aa  288  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  63.32 
 
 
236 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  55.65 
 
 
252 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  55.65 
 
 
252 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  56.39 
 
 
247 aa  254  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  51.9 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  50.21 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  51.9 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  51.9 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  51.9 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  51.9 
 
 
245 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  49.79 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  49.79 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  49.79 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  49.79 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  49.79 
 
 
249 aa  231  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  49.79 
 
 
249 aa  231  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  50 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  51.9 
 
 
251 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.191907 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
249 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  42.92 
 
 
251 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  40.91 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  40.08 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  38.67 
 
 
311 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  34.47 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  37.78 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  33.19 
 
 
405 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  37.9 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  41.04 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 
259 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  34.48 
 
 
258 aa  115  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  36.24 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  34.53 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  36.99 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  33.88 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  39.91 
 
 
271 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  35.48 
 
 
262 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  36.8 
 
 
259 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.62 
 
 
265 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 
256 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  30 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.07 
 
 
268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  33.62 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  37.73 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.68 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  35.86 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
272 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  28.45 
 
 
290 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  35.22 
 
 
270 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  36.93 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  35.71 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  36.82 
 
 
262 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
256 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  35.22 
 
 
270 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  37.29 
 
 
255 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
264 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
262 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
256 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 
256 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
256 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 
256 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  36.48 
 
 
384 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  37.19 
 
 
255 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  39.06 
 
 
277 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  35.51 
 
 
260 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  38.03 
 
 
286 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
256 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.45 
 
 
259 aa  106  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
294 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 
256 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.7 
 
 
263 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 
251 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  39.91 
 
 
273 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  32.05 
 
 
256 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  37.21 
 
 
266 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  38.08 
 
 
269 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  35.19 
 
 
419 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  37.56 
 
 
266 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
266 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
265 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  36.6 
 
 
270 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  35.22 
 
 
264 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.09 
 
 
290 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>