30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1030 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1030  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0796  FMN-binding domain protein  91.54 
 
 		 130 aa  243  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3180  FMN-binding domain protein  72.12 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.321084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3251  FMN-binding domain protein  73.79 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.963687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.82 
 
 		 628 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  43.3 
 
 		 657 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.83 
 
 		 640 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  41.3 
 
 		 715 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  35 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  39.77 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  38.83 
 
 		 702 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1780  FMN-binding domain protein  46.43 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  38.2 
 
 		 597 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.56 
 
 		 650 aa  50.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21270  hypothetical protein  43.59 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  36.96 
 
 		 591 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  33.62 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 598 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  31.3 
 
 		 637 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  28.89 
 
 		 1004 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  35.16 
 
 		 616 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  31.25 
 
 		 725 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3782  FMN-binding domain protein  43.06 
 
 		 715 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440346  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24380  hypothetical protein  37 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  32.14 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  30.36 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  35.56 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.48 
 
 		 584 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.32 
 
 		 597 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>