119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4044 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  100 
 
 		 504 aa  972    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  38.54 
 
 		 409 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  39.34 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  39.85 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  30.73 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  30.73 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  30.16 
 
 		 414 aa  144  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  32.03 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  32.35 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  34.96 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  28.26 
 
 		 406 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  27.59 
 
 		 400 aa  123  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  30.59 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  32.38 
 
 		 403 aa  120  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  34.52 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  35.26 
 
 		 392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  28.53 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  32.71 
 
 		 390 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  32.72 
 
 		 389 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  28.14 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  28.15 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  37.18 
 
 		 391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  27.62 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  29.48 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  34.32 
 
 		 390 aa  114  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  32.16 
 
 		 390 aa  113  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  28.42 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  24.86 
 
 		 394 aa  110  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  31.68 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  30.29 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  36.48 
 
 		 396 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  33.78 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  28.03 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  31.32 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  30.69 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  30.69 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  30.69 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  30.69 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  30.65 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  26.89 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  31.18 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  32.37 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  29.52 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  29.97 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  31.51 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  26.88 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  30.03 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  29.68 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  30.95 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  28.87 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  29.64 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  29.91 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  30.95 
 
 		 398 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  30.95 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  29.23 
 
 		 390 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  28.9 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  29.63 
 
 		 390 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  30.31 
 
 		 393 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  28.97 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  28.3 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  29.97 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  29.44 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  34.05 
 
 		 404 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  30.05 
 
 		 398 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  28.53 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  32.5 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  31.71 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  29.11 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  25.95 
 
 		 401 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  30.32 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  29.14 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  32.06 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  32.06 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  30.26 
 
 		 401 aa  87.4  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  29.66 
 
 		 401 aa  86.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  26.96 
 
 		 403 aa  86.7  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  29.66 
 
 		 401 aa  86.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  28.77 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  29.55 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  29.71 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  31.1 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  25.36 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  34.86 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  31.45 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  30.82 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  31.1 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  27.81 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  30.7 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1485  NnrS-like protein  31.06 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0230809  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  29.61 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  29.89 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2680  NnrS family protein  43.3 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  27.89 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  32.14 
 
 		 229 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1808  NnrS family protein  41.18 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0928  NnrS family protein  26.4 
 
 		 397 aa  62  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0391816  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  28.57 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  22.63 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  28.43 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  27.67 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>