More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3341 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  100 
 
 		 317 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  71.75 
 
 		 178 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  94.33 
 
 		 141 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  68.82 
 
 		 182 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  66.67 
 
 		 180 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  69.28 
 
 		 175 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  67.47 
 
 		 175 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  68.07 
 
 		 175 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  67.27 
 
 		 175 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  66.47 
 
 		 175 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  67.07 
 
 		 175 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  65.48 
 
 		 189 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  65.45 
 
 		 175 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  65.87 
 
 		 175 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  67.72 
 
 		 179 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  64.67 
 
 		 175 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  65.06 
 
 		 176 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  75.18 
 
 		 142 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  77.54 
 
 		 141 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  76.81 
 
 		 143 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  77.54 
 
 		 142 aa  222  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  75.35 
 
 		 142 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  61.73 
 
 		 169 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.61 
 
 		 176 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  71.63 
 
 		 141 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  71.33 
 
 		 145 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  72.86 
 
 		 144 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  73.19 
 
 		 141 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  75 
 
 		 145 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  72.34 
 
 		 145 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  71.74 
 
 		 141 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  73.91 
 
 		 141 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  57.67 
 
 		 165 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  60.74 
 
 		 179 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  71.83 
 
 		 143 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  57.31 
 
 		 179 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  71.74 
 
 		 141 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  66.67 
 
 		 141 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  72.46 
 
 		 141 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  70.92 
 
 		 141 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  70.92 
 
 		 145 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  72.46 
 
 		 145 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  70.8 
 
 		 143 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  58.49 
 
 		 164 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  73.19 
 
 		 141 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  70.29 
 
 		 146 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  57.86 
 
 		 165 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  56.63 
 
 		 164 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  70.5 
 
 		 140 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  55.97 
 
 		 165 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  56.6 
 
 		 162 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  67.14 
 
 		 140 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.94 
 
 		 165 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  54.32 
 
 		 164 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  56.79 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  67.15 
 
 		 148 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  54.94 
 
 		 164 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  71.74 
 
 		 141 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.36 
 
 		 175 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  56.1 
 
 		 171 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.36 
 
 		 175 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  57.06 
 
 		 165 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  70 
 
 		 140 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  67.88 
 
 		 140 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  66.91 
 
 		 140 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  67.14 
 
 		 140 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  55.42 
 
 		 164 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  68.61 
 
 		 143 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  68.61 
 
 		 140 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  67.88 
 
 		 140 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  64.75 
 
 		 162 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  52.35 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.82 
 
 		 164 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  64.54 
 
 		 141 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  64.75 
 
 		 140 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  61.87 
 
 		 140 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  54.94 
 
 		 164 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  65.94 
 
 		 140 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  56.33 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  52.2 
 
 		 164 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  66.42 
 
 		 140 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  52.8 
 
 		 170 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  60.87 
 
 		 140 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  54.43 
 
 		 165 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  65.69 
 
 		 144 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  50.6 
 
 		 173 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  63.31 
 
 		 143 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  61.87 
 
 		 142 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  51.48 
 
 		 177 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  67.18 
 
 		 137 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  61.59 
 
 		 140 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  62.22 
 
 		 158 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  62.22 
 
 		 158 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  67.18 
 
 		 138 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  64.23 
 
 		 140 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  60.87 
 
 		 151 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  63.36 
 
 		 134 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>