36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1869 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  38.79 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  35.45 
 
 		 314 aa  169  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  55.17 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  55.17 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  55.42 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  47.73 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  45.21 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  31.32 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  32.04 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  32.14 
 
 		 472 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  40.28 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  29.17 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  27.63 
 
 		 993 aa  53.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  39.08 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  40.96 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  37.66 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  36.99 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  27.45 
 
 		 966 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  27.61 
 
 		 990 aa  50.4  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  32 
 
 		 911 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  28.18 
 
 		 978 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  34.44 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.68 
 
 		 489 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  27.47 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  29.03 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  25.17 
 
 		 545 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  28.83 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  39.13 
 
 		 264 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  29.82 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  34.29 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 		 237 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  28.05 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>