More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1462 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
128 aa  260  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  43.09 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  42.4 
 
 
170 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  42.06 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  38.4 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  40.16 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2998  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  40.48 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  41.44 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.138854 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  39.68 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  43.81 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  42.72 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  44.09 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  43.69 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  41.59 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  40.5 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  45.05 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  41.09 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  42.16 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  38.68 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  40.2 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  41.44 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  43 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  38.6 
 
 
290 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  37.5 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  34.85 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.72 
 
 
291 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  38.83 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  42.86 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.04 
 
 
291 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  40.21 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3696  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0328  GCN5-related N-acetyltransferase  43.01 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  41.94 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0321  GCN5-related N-acetyltransferase  44.09 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.213588  normal  0.99625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  44.29 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  45.78 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
173 aa  58.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  41.41 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  32.43 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0330  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537741  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5984  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
291 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  42.5 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
183 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  39.47 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.95 
 
 
294 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0756  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376269  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  40.86 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00053276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  42.31 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3527  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000812311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3403  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00605  acetyltransferase, GNAT family protein  32.54 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  39.09 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.650699  normal  0.498488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0426  GCN5-related N-acetyltransferase  40.86 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  40.86 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.61 
 
 
291 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1106  histone acetyltransferase HPA2  40.62 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
160 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
291 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  39.47 
 
 
159 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
182 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1612  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
169 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122446  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2710  acetyltransferase, gnat family  39.47 
 
 
99 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.941065  normal  0.335469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  35.24 
 
 
171 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  40.66 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4059  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3599  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0459  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.359836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>