123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1034 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  73.6 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  66.08 
 
 
182 aa  221  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  64.07 
 
 
182 aa  209  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  63.01 
 
 
177 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  66.25 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  63.52 
 
 
175 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  64.67 
 
 
176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  63.52 
 
 
175 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  63.52 
 
 
175 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  63.52 
 
 
175 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  63.52 
 
 
175 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  58.62 
 
 
175 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  65.41 
 
 
177 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  63.52 
 
 
426 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  62.5 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  60.34 
 
 
176 aa  194  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  61.33 
 
 
176 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  61.33 
 
 
176 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  66.88 
 
 
176 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  61.64 
 
 
175 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  61.18 
 
 
198 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
178 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  64.47 
 
 
173 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  54.97 
 
 
172 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  53.46 
 
 
175 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  52.69 
 
 
174 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
172 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  53.16 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  49.36 
 
 
175 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  48.41 
 
 
172 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  44.52 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  44.59 
 
 
174 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
182 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
175 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  42.48 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  40.83 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  38.36 
 
 
167 aa  111  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  49.02 
 
 
196 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  41.78 
 
 
173 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  39.74 
 
 
167 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  39.74 
 
 
167 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  37.74 
 
 
167 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  41.56 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  38.31 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  40.52 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  44.65 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  44.87 
 
 
175 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  37.82 
 
 
167 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
170 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  47.79 
 
 
153 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  35.33 
 
 
167 aa  101  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 
177 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  40.91 
 
 
181 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  36.69 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2000  hypothetical protein  28.37 
 
 
201 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
128 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0869  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
152 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2211  acetyltransferase, GNAT family  33.67 
 
 
143 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  24.59 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3114  acetyltransferase, GNAT family  33.67 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.648197  hitchhiker  0.000000691419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2072  acetyltransferase  33.67 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2011  acetyltransferase  33.67 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2010  acetyltransferase  33.67 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.818769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2227  acetyltransferase  33.67 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2255  acetyltransferase, GNAT family  33.67 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.60781e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00776574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1003  acetyltransferase, GNAT family  32.93 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  27.63 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2221  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2267  GCN5-related N-acetyltransferase  33.03 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0656952  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  24.09 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54285  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0070  hypothetical protein  35.59 
 
 
494 aa  44.3  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2257  acetyltransferase  32.65 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.042527  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2804  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.788725  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2185  acetyltransferase  34.78 
 
 
83 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2339  acetyltransferase, GNAT family  32.65 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2458  acetyltransferase  27.27 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000129443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3571  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3203  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4774  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3393  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.229217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4123  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494733  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2748  acetyltransferase, gnat family  28.41 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2606  acetyltransferase  28.12 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2697  acetyltransferase, gnat family  27.27 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000437852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>