51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1353 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  239  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  73.33 
 
 
127 aa  174  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  80.61 
 
 
113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  46.88 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  46.88 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  44.09 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  47.92 
 
 
97 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  48.86 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  47.87 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  45.98 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  42.05 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  38.95 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  39.18 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  40.24 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  41.67 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  36.27 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  36.46 
 
 
101 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  31.86 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  31.4 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  32.5 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  33.66 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  30.23 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  29.07 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  30.23 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  29.63 
 
 
112 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  28.74 
 
 
102 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  30.68 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  33.73 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  43.4 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  34.43 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  31.96 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  34.34 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  41.46 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  34.41 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  36.96 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  25.81 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  32.43 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  23.85 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  30.51 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  25.88 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>