71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2905 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.54 
 
 		 267 aa  285  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.45 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.35 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.71 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.73 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.16 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  39.55 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.98 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.13 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.91 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.95 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.02 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.88 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.17 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.65 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1416  iron-sulfur cluster-binding protein  48.98 
 
 		 99 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.584187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.1 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.46 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 367 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.28 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46 
 
 		 365 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.05 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.54 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.92 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.9 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  34.38 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 427 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000011371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  37.68 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.6 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.97 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  22.58 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.68 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00514975  hitchhiker  0.000746109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1432  pyruvate kinase  29.47 
 
 		 569 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.33 
 
 		 301 aa  45.4  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44 
 
 		 367 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0910  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00418266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  42.31 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.83 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  21.77 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.581706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 477 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  26.26 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1379  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.91 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.860949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  31.88 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  29.07 
 
 		 553 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  39.62 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.63 
 
 		 175 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.68 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2401  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.65 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.537791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  40.43 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  39.29 
 
 		 392 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  34.78 
 
 		 382 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0786  ech hydrogenase subunit F  37.31 
 
 		 114 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  32.47 
 
 		 503 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.84 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0868  hydrogenase, EchF subunit, putative  35.82 
 
 		 114 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.246901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.96 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 148 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.191314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0347  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit H  43.48 
 
 		 148 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.573694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 148 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1946  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 58 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  50 
 
 		 263 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1281  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  41.18 
 
 		 477 aa  42  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003497  iron-sulfur cluster-binding protein  29.07 
 
 		 553 aa  42  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>