42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2817 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  32.14 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.62 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.85 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  29.35 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  36.84 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  33.78 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  35.59 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  29.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.85 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  28.07 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  36.14 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.37 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  27.91 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  32.1 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  26.32 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  33.82 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0020  hypothetical protein  24.8 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  34.38 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.66 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  28.1 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  36.07 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  26.32 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.93 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.5 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  28.7 
 
 		 142 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  25.71 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  25.74 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  35.44 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>