More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1671 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1671  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 471 aa  974    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000001751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1768  ParA family protein  47.08 
 
 		 466 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0448831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1849  ParA family protein  45.81 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.163718  normal  0.831565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1889  chromosome partitioning ATPase  44.92 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000177621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1916  ParA family protein  42.79 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1254  chromosome partitioning ATPase  41.34 
 
 		 457 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000381777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3029  chromosome partitioning ATPase  40.91 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  42.83 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  32 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  26.64 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  27.66 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.41 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.9 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.77 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  27.2 
 
 		 254 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  25.93 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.47 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  31.84 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  28.65 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.51 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24.07 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  28.07 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.74 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.46 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3098  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.21 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.97 
 
 		 259 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.13 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 		 268 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 		 254 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  29.59 
 
 		 266 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 		 272 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 		 249 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 		 262 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 286 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 286 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  28.06 
 
 		 253 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 259 aa  53.9  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 		 391 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 		 248 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 		 277 aa  53.5  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 		 329 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.43 
 
 		 258 aa  53.5  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.86 
 
 		 262 aa  53.5  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 297 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.33 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  28.04 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 255 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  28.04 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  27.95 
 
 		 257 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.07 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  28.35 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  28.49 
 
 		 254 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.19 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.04 
 
 		 262 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.08 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  32.19 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  25.26 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1056  chromosome partitioning ATPase  26.51 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  hitchhiker  0.00567029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.22 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  27.54 
 
 		 256 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  30.13 
 
 		 265 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 256 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  29.63 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  27.91 
 
 		 265 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  25.77 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  26.94 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  25.5 
 
 		 264 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.49 
 
 		 249 aa  51.6  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  27.91 
 
 		 265 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.7 
 
 		 273 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0556  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.98 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 		 264 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.87 
 
 		 249 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  30.92 
 
 		 319 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  25.71 
 
 		 238 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 		 264 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.07 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 		 254 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.15 
 
 		 257 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.07 
 
 		 317 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 		 263 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  28.93 
 
 		 265 aa  50.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 		 282 aa  50.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  25.26 
 
 		 288 aa  50.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  24.88 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>