216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1226 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1226  glycerate kinase  100 
 
 		 373 aa  733    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  45.75 
 
 		 371 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  43.7 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  43.7 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  43.7 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  43.7 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  45.11 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  43.28 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  39.35 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  41.82 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  41.82 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  45.43 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  44.92 
 
 		 384 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  41.67 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  41.67 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  41.4 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  41.4 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  41.13 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  41.13 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  41.33 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  40.37 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  42.36 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  41.07 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  43.46 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  42.86 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  42.47 
 
 		 376 aa  240  4e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  42.37 
 
 		 380 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  40.53 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  40.53 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  39.35 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  41.94 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  40.85 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  44.5 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  40.26 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  40.26 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.35 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  40.26 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  40.26 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  43.58 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  40.26 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  40.26 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  40.26 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  38.12 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  36.04 
 
 		 374 aa  235  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  41.18 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  41.18 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  42.36 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  41.07 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  40.21 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  40.86 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  41.16 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  42.02 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  41.47 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  38.92 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  40.21 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1859  glycerate kinase family protein  42.42 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  41.59 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  43.01 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  41.33 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  41.33 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  41.99 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  42.9 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  42.9 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  41.33 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  42.9 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  42.63 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.07 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  43.82 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  44.39 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  39.95 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1372  glycerate kinase  42.86 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125606 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  38.34 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  42.06 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  43.68 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  35.12 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  38.99 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.07 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  38.61 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  41.49 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  40.26 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2071  glycerate kinase  38.54 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000043752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  40.05 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  40.8 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  42.02 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  39.42 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  39.95 
 
 		 403 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  41.69 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  39.89 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  36.97 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  37.78 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  39.12 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  41.76 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  43.82 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  42.74 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2001  glycerate kinase  42.22 
 
 		 369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2047  glycerate kinase  42.22 
 
 		 369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1982  glycerate kinase  42.48 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  39.8 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  40.24 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  36.73 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>