35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0455 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  100 
 
 		 74 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  63.51 
 
 		 74 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  52.7 
 
 		 74 aa  84.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  51.35 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  51.35 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  51.35 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  44.59 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  45.33 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.35 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  47.3 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  44.59 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  47.3 
 
 		 74 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  43.24 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  41.56 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  41.67 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  37.84 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  36.49 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  35.44 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  33.33 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  32.14 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  29.73 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  29.87 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  32.91 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0111  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.9 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129996  normal  0.207876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  32.43 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2136  molybdopterin synthase subunit MoaE / molybdopterin synthase subunit MoaD  37.04 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1759  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.59 
 
 		 222 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.940136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.27 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  26.19 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  38.27 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0524  thiamineS  29.35 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0334  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.18 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  28.74 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  28.92 
 
 		 85 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2368  MoaD family protein  30.86 
 
 		 228 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>