More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1137 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 588 aa  659    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  83.33 
 
 		 570 aa  988    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  82.46 
 
 		 570 aa  979    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 570 aa  1146    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  82.81 
 
 		 570 aa  1003    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 574 aa  512  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 566 aa  495  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 555 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 555 aa  425  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 571 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 561 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 561 aa  388  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 569 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 560 aa  375  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 562 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 634 aa  365  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 582 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 573 aa  313  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 574 aa  306  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 569 aa  290  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 579 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 553 aa  216  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 587 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 569 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 555 aa  213  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 565 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 565 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 557 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 568 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 781 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 552 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 554 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  31.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 555 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 555 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 555 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 555 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 		 554 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 816 aa  206  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 555 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 555 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 579 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 556 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 559 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 556 aa  200  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 554 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 579 aa  200  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 555 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 799 aa  199  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 596 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 569 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 580 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 794 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 552 aa  197  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 561 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 569 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 556 aa  196  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 597 aa  196  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 609 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 778 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 569 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>