117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2613 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2613  patatin  100 
 
 		 415 aa  852    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  70.33 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  67.36 
 
 		 383 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  68.28 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  67.77 
 
 		 380 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  68.28 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  67.07 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  70.07 
 
 		 335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  69.41 
 
 		 335 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  64.06 
 
 		 378 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  49.19 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  45.86 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  39.23 
 
 		 638 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  37.31 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  37.31 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  34.69 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  37.01 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  35 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  34.69 
 
 		 364 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  34.69 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  34.69 
 
 		 357 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  36.75 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  33.43 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  33.43 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  33.43 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  33.43 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  33.13 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  33.13 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  33.13 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  33.13 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  33.13 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  35.86 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  32.48 
 
 		 305 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  32.89 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  38.36 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  36.32 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  36.32 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  29.97 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  32.11 
 
 		 290 aa  130  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  29.58 
 
 		 290 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  29.23 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  25.47 
 
 		 284 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  27.01 
 
 		 283 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  28.66 
 
 		 290 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  28.66 
 
 		 290 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  27.51 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  30.59 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  25.29 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  25.29 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  24.9 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  25.29 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  31.82 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  25.38 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  25.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  25.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  25.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  25.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  25.28 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  25.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  25.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  24.91 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  24.53 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  24.9 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  24.91 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  24.9 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  27.02 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  29.22 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  29.22 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  24.22 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  29.22 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  24.61 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  24.81 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  28.77 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  28.3 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  27.95 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  27.55 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  25.44 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  25.99 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  27.27 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  29.25 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  23.62 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  26.05 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.33 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  21.5 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  26.7 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  24.71 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14077  predicted protein  26.54 
 
 		 594 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  25 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  29.1 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.35 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  22.1 
 
 		 300 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  22.1 
 
 		 300 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  26.05 
 
 		 381 aa  46.6  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  21.96 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  53.49 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  22.1 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  22.33 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  48.21 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  22.1 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  22.1 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>