More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0411 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  100 
 
 		 357 aa  740    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  39.71 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  39.27 
 
 		 378 aa  269  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  38.75 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 373 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  37.61 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  38.75 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  37.61 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  37.61 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  37.32 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  37.32 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  36.31 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  37.69 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  35.65 
 
 		 371 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  29.29 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  25.15 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  26.85 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  29.56 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.93 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  27.06 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  23.7 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  27.01 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  25.15 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1156  kynureninase  29.39 
 
 		 435 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  27.56 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  27.62 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  24.32 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  28.47 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1054  kynureninase  26.07 
 
 		 416 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2602  kynureninase  26.79 
 
 		 418 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1967  kynureninase  26.79 
 
 		 418 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0893  kynureninase  26.07 
 
 		 416 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0896  kynureninase  26.07 
 
 		 416 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2578  kynureninase  26.79 
 
 		 418 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0099  kynureninase  26.07 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0352  kynureninase, putative  26.07 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0651  kynureninase  26.07 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2486  kynureninase  26.07 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02408  Kynureninase  27.17 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  26.43 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0710  kynureninase  25.71 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0491742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.3 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2626  kynureninase  26.43 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.01 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  26.77 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  27.24 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3019  kynureninase  29.3 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0719  kynureninase  26.07 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76256  normal  0.281792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  23.92 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2164  kynureninase  24.04 
 
 		 434 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0484937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  27.74 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1534  kynureninase  26.98 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.213107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1448  kynureninase  26.14 
 
 		 425 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  25 
 
 		 397 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  27.01 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5909  kynureninase  26.07 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  22.94 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2439  kynureninase  25.84 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0265  kynureninase  26 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  24.62 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  25.61 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2559  kynureninase  23.99 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0488118  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5245  kynureninase  26.6 
 
 		 411 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.668711 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2567  kynureninase  23.78 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2753  kynureninase  23.78 
 
 		 428 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1518  kynureninase  25.26 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0681881  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2523  kynureninase  24.05 
 
 		 428 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000799329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2808  kynureninase  23.78 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2761  kynureninase  24.05 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  26.07 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  25.95 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2787  kynureninase  23.24 
 
 		 428 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00906384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  24.22 
 
 		 416 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  25.53 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2025  aminotransferase class V  24.17 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2488  kynureninase  23.51 
 
 		 428 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.819206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  24.22 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  22.88 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.14 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0922  kynureninase  34.71 
 
 		 413 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.50677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2766  kynureninase  22.62 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2526  kynureninase  22.4 
 
 		 428 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  24.43 
 
 		 416 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2225  kynureninase  25.99 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  23.47 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0589  aminotransferase class V  25.57 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.67 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  25.87 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  25.66 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  29.18 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  28.99 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  24.91 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  24.15 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  29.48 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  26.07 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  27.55 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  26 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4630  kynureninase  29.31 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0472348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  20.71 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  23.65 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>