38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2231 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  87.43 
 
 		 195 aa  348  3e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  90.61 
 
 		 191 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  87.03 
 
 		 194 aa  308  4e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.68 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  43.17 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.26 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  41.24 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.7 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.99 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.16 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.87 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.87 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.61 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.26 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  34.05 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  34.05 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  31.89 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.11 
 
 		 192 aa  100  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  35.57 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  33.71 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  35.57 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.24 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  34.07 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  33.88 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.46 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  30.81 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.47 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  30.36 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  26.29 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  26.81 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  27.97 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  28.81 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01447  DNA-directed RNA polymerase III subunit 22.9 kDa, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04350)  26.8 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  24.68 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01521  RNA polymerase II subunit 7 (AFU_orthologue; AFUA_8G05300)  24.84 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01580  hypothetical protein  27.37 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>