29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0443 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  97.76 
 
 
342 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  37.18 
 
 
304 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  37.3 
 
 
305 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  35.96 
 
 
322 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  35.26 
 
 
306 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  38.1 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  34.94 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  34.94 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  35.92 
 
 
292 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  34.71 
 
 
306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  35.78 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  35.9 
 
 
309 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  35.6 
 
 
292 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  30.97 
 
 
301 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  30.89 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  27.11 
 
 
584 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  30.51 
 
 
707 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  29.79 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  25.97 
 
 
695 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.79 
 
 
699 aa  63.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.97 
 
 
699 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  21.64 
 
 
704 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  30.43 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  27.18 
 
 
697 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  26.21 
 
 
697 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  34.15 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  32.53 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  24.36 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>