19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2860 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  60.42 
 
 
331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  59.46 
 
 
332 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  39.35 
 
 
372 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  37.83 
 
 
292 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  38.68 
 
 
382 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  37.55 
 
 
395 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  36.54 
 
 
385 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  38.21 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0335  hypothetical protein  68.42 
 
 
104 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0414983  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  32.16 
 
 
358 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  32.16 
 
 
358 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  25.11 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  34.33 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  29.22 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  27.67 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  29.82 
 
 
364 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  25 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  24.36 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>