21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1622 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  690    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  28.62 
 
 
345 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  34.68 
 
 
364 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  29.94 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  29.96 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  33.09 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  42.11 
 
 
117 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  34.83 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  31.03 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  34.33 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  27.41 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  29.88 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  32.26 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  28.12 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  27.72 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  29.41 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  29.41 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0335  hypothetical protein  46.15 
 
 
104 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0414983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  22.35 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  21.55 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>