15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1334 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  765    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1611  hypothetical protein  37.7 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0620  hypothetical protein  36.55 
 
 
382 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.500852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  37.43 
 
 
387 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  63.03 
 
 
722 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  38.84 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  36.05 
 
 
401 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3875  hypothetical protein  38.14 
 
 
367 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1064  hypothetical protein  36.9 
 
 
130 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.49397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  30.07 
 
 
842 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0870  hypothetical protein  29.83 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.341415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  22.42 
 
 
402 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2985  hypothetical protein  24.71 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000470132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  21.55 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1150  hypothetical protein  24.87 
 
 
392 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>