19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4817 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  78.72 
 
 		 331 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  59.46 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  38.22 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  37.73 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  37.62 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  38.81 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0335  hypothetical protein  90.79 
 
 		 104 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0414983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  37.02 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  36.68 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  26.32 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  28.78 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  26.49 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  27.5 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  33.73 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  32.53 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>