23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6043 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  735    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0141  hypothetical protein  58.44 
 
 
402 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  37.6 
 
 
364 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  60.68 
 
 
117 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  31.08 
 
 
361 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  29.94 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  29.5 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  32.32 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  23.69 
 
 
385 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  31.58 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  27.06 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  27.07 
 
 
362 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  29.22 
 
 
382 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  31.03 
 
 
395 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  29.41 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  24.26 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  24.26 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  27.5 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3875  hypothetical protein  29.02 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  27.73 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  25.5 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  24.16 
 
 
244 aa  43.9  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  32.48 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>