13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0869 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  800    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1611  hypothetical protein  36.1 
 
 
392 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  37.43 
 
 
378 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0620  hypothetical protein  36.65 
 
 
382 aa  229  6e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.500852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3875  hypothetical protein  39.94 
 
 
367 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  41.52 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  46.35 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0870  hypothetical protein  28.45 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.341415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1150  hypothetical protein  28.93 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  27.06 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2985  hypothetical protein  26.98 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000470132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  24.83 
 
 
722 aa  56.6  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  25 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>