13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4409 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  796    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  46.35 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  40.53 
 
 
346 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0620  hypothetical protein  41.64 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.500852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  36.05 
 
 
378 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1611  hypothetical protein  38.35 
 
 
392 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3875  hypothetical protein  40.07 
 
 
367 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  23.6 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0870  hypothetical protein  33.66 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.341415  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001490  hypothetical protein  23.57 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.325195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  27.73 
 
 
358 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1150  hypothetical protein  27.33 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  29.22 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>