11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0620 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0620  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  772    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.500852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  36.55 
 
 
378 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  36.65 
 
 
387 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1611  hypothetical protein  31.94 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  39.52 
 
 
346 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3875  hypothetical protein  37.26 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  41.64 
 
 
401 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  35.66 
 
 
722 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0870  hypothetical protein  29.89 
 
 
345 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.341415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  22.03 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1064  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.49397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>