12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3875 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3875  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  39.94 
 
 
387 aa  236  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1611  hypothetical protein  38.25 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0620  hypothetical protein  37.88 
 
 
382 aa  209  7e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.500852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  44.07 
 
 
346 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  40.07 
 
 
401 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  38.28 
 
 
378 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0870  hypothetical protein  28.77 
 
 
345 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.341415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  19.32 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001490  hypothetical protein  28.99 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.325195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  29.02 
 
 
358 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2985  hypothetical protein  23.81 
 
 
389 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000470132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>