20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1784 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  68.09 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  54.26 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  53.5 
 
 		 395 aa  315  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  48.29 
 
 		 372 aa  249  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  37.83 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  41.47 
 
 		 361 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  37.02 
 
 		 332 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  36 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  25.79 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  27.46 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  31.03 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  30.86 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0335  hypothetical protein  40.32 
 
 		 104 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0414983  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  27.1 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  36.17 
 
 		 117 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  26.22 
 
 		 362 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>