15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1904 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  735    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  29.82 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  29.96 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  27.84 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  27.4 
 
 
361 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3319  hypothetical protein  25.32 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  27.07 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  24.77 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  33.05 
 
 
117 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  25.35 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  26.22 
 
 
292 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  26.9 
 
 
372 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0822  hypothetical protein  22.15 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0838  hypothetical protein  22.15 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  22.75 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>