14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3319 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3319  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  644    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0822  hypothetical protein  34.98 
 
 
318 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0838  hypothetical protein  34.98 
 
 
318 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0763  hypothetical protein  38.03 
 
 
310 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0433  hypothetical protein  30.77 
 
 
310 aa  143  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0931  hypothetical protein  39.53 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.380231 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0368  hypothetical protein  30.38 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2321  hypothetical protein  26.54 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0634  hypothetical protein  28.87 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  32.61 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  25.94 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  23.57 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  22.62 
 
 
382 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  25.32 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>