13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0433 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0433  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  630  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0763  hypothetical protein  39.48 
 
 
310 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0931  hypothetical protein  40.07 
 
 
309 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.380231 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0368  hypothetical protein  36.05 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0822  hypothetical protein  34.53 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0838  hypothetical protein  34.53 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2321  hypothetical protein  31.85 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3319  hypothetical protein  30.77 
 
 
317 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0634  hypothetical protein  30.21 
 
 
391 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  25.71 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  23.99 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  25.28 
 
 
395 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  23.12 
 
 
385 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>