25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4471 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  790    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  68.09 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  52.69 
 
 
385 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  50.13 
 
 
395 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  43.63 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  38.68 
 
 
332 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  40.78 
 
 
361 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  37.62 
 
 
332 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  34.63 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  30 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  30 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  28.38 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  34.83 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  28.79 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0433  hypothetical protein  23.99 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  35.24 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3319  hypothetical protein  22.62 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0335  hypothetical protein  32.99 
 
 
104 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0414983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  29.22 
 
 
358 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  36.17 
 
 
117 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  25.35 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  26.45 
 
 
244 aa  50.4  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0838  hypothetical protein  21.92 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0822  hypothetical protein  21.92 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0931  hypothetical protein  21.33 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.380231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>