22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1260 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  751    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  43.63 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  42.59 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  42.55 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  47.12 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  42.14 
 
 		 361 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  39.35 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  38.22 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  37.38 
 
 		 331 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  33.15 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  30.18 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  30.18 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  31.19 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0433  hypothetical protein  27.2 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3319  hypothetical protein  26.36 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  29.88 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  29.25 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  32.52 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0335  hypothetical protein  35.9 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0414983  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  27.94 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  25.97 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>