18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0223 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  60.68 
 
 		 358 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  49.51 
 
 		 364 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  42.11 
 
 		 345 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  35.16 
 
 		 345 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1904  hypothetical protein  33.05 
 
 		 362 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  36.17 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  36.17 
 
 		 382 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  30.84 
 
 		 361 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  35.29 
 
 		 385 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  37.5 
 
 		 395 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  31.58 
 
 		 354 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0854  hypothetical protein  32.5 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  31.43 
 
 		 358 aa  42  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  31.43 
 
 		 358 aa  42  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0240  hypothetical protein  33.77 
 
 		 246 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.691595  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0027  protein of unknown function DUF91  26.32 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>