18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0636 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  721    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  77.21 
 
 
358 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  77.21 
 
 
358 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  33.5 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  27.69 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  30.11 
 
 
244 aa  88.6  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  26.32 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  31.19 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  25.79 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  25.11 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  28.38 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  26.52 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  27.17 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  27.72 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  27.63 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1494  hypothetical protein  37.1 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  25.5 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0223  hypothetical protein  31.58 
 
 
117 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.178358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>