15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0335 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0335  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0414983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  90.79 
 
 
332 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  80.26 
 
 
331 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  68.42 
 
 
332 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  35.9 
 
 
372 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  32.99 
 
 
382 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  35.53 
 
 
385 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  40.32 
 
 
292 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  39.19 
 
 
395 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  37.31 
 
 
361 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  46.15 
 
 
345 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  45.45 
 
 
345 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  38.78 
 
 
358 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  38.78 
 
 
358 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  38.78 
 
 
354 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>