More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01794 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  100 
 
 		 465 aa  914    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  72.83 
 
 		 475 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  73.84 
 
 		 469 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  73.23 
 
 		 474 aa  693    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  73.22 
 
 		 470 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  73 
 
 		 470 aa  694    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  59.96 
 
 		 469 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  54.49 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  54.49 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  56.22 
 
 		 477 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  56.7 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  54.45 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  51.73 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  53.23 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  48.9 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  52.88 
 
 		 524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  48.44 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  48.44 
 
 		 468 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  49.45 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  49.45 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  48.21 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  48.7 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  48.8 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  48.79 
 
 		 474 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  48.8 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  48.8 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  53.91 
 
 		 458 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  47.24 
 
 		 473 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  47.24 
 
 		 473 aa  455  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  47.24 
 
 		 473 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  48.37 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  46.8 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  48.37 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  47.24 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  47.8 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  47.24 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  47.24 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  47.46 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  48.66 
 
 		 476 aa  448  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  46.7 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  46.8 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  47.68 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  47.87 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  46.93 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  47.43 
 
 		 468 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  47.07 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  47.07 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  46.82 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  47.05 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  46.85 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  47.07 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  47.07 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  47.05 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  47.07 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  46.09 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  46.09 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  41.76 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  37.74 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  37.31 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  37.53 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  37.53 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  37.74 
 
 		 488 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  37.74 
 
 		 488 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  37.74 
 
 		 488 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 488 aa  336  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  37.53 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  37.31 
 
 		 488 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  37.09 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 		 490 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  38.17 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  38.17 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  39.37 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  39.45 
 
 		 526 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  37.45 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  40.41 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  38.27 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  38.11 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  38.05 
 
 		 526 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  38.05 
 
 		 526 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  38.05 
 
 		 526 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  38.94 
 
 		 511 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  38.41 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 511 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  38.33 
 
 		 520 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  38.19 
 
 		 487 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  37.94 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  37.94 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  37.94 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  37.94 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  37.94 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  37.94 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 511 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 538 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 538 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  37.45 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  37.45 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  37.45 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  37.45 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  37.45 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>