88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00684 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  61.89 
 
 
650 aa  777    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  100 
 
 
630 aa  1292    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  76.14 
 
 
653 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  76.48 
 
 
653 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  76.65 
 
 
653 aa  930    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  76.14 
 
 
653 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  76.18 
 
 
653 aa  926    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  63.19 
 
 
678 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  65.47 
 
 
651 aa  781    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  60.37 
 
 
688 aa  703    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  63.5 
 
 
631 aa  820    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  71.04 
 
 
650 aa  925    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  72.95 
 
 
678 aa  917    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  72.9 
 
 
652 aa  913    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  72.95 
 
 
678 aa  917    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  70.18 
 
 
662 aa  882    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  71.73 
 
 
651 aa  918    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  73.49 
 
 
653 aa  919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  76.14 
 
 
653 aa  925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  71.73 
 
 
654 aa  916    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  62.91 
 
 
673 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  76.48 
 
 
653 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  73.33 
 
 
654 aa  922    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  75.8 
 
 
653 aa  932    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  54.68 
 
 
648 aa  693    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  71.04 
 
 
650 aa  925    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  42.55 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  37.12 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  33.33 
 
 
607 aa  273  7e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  66.33 
 
 
253 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  33.16 
 
 
630 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  37.04 
 
 
625 aa  252  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  28.83 
 
 
626 aa  146  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  28.67 
 
 
631 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  27.29 
 
 
624 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  28 
 
 
612 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  26.33 
 
 
883 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  26.8 
 
 
884 aa  92  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  26.27 
 
 
887 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.42 
 
 
593 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  21.88 
 
 
593 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  23.71 
 
 
696 aa  64.7  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  21.32 
 
 
593 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  24.89 
 
 
708 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  23.58 
 
 
704 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  24.39 
 
 
695 aa  60.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  25.17 
 
 
689 aa  60.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  24.04 
 
 
680 aa  59.7  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 
596 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  23.78 
 
 
715 aa  58.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  32.84 
 
 
476 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  24.95 
 
 
698 aa  57.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  23.01 
 
 
681 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  23.97 
 
 
694 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  30 
 
 
587 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  24.9 
 
 
677 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  22.99 
 
 
667 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  23.19 
 
 
629 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  24.66 
 
 
736 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  30.57 
 
 
632 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  22.12 
 
 
699 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  24.23 
 
 
821 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  22.12 
 
 
699 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  27.68 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  24.14 
 
 
651 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  24.23 
 
 
689 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  22.12 
 
 
699 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  22.16 
 
 
638 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  22.91 
 
 
702 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  22.34 
 
 
662 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  27.16 
 
 
663 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  24.02 
 
 
708 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  23.84 
 
 
738 aa  48.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  29.06 
 
 
383 aa  47.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  25.22 
 
 
639 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  25.4 
 
 
386 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  24.07 
 
 
638 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  25.78 
 
 
659 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  23.62 
 
 
693 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  25.16 
 
 
642 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  26.5 
 
 
383 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  25.78 
 
 
659 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  26.79 
 
 
663 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  22.91 
 
 
674 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 
494 aa  44.3  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  27.91 
 
 
669 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  23.03 
 
 
690 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 
658 aa  43.5  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>