36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4274 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  74.65 
 
 		 221 aa  332  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  35.02 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0147  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  25.37 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28950  Transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 242 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>