40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3246 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  84.05 
 
 		 231 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  58.29 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4638  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.66 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000101214  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4776  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.89 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2981  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.85 
 
 		 172 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0189678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2560  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.72 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2374  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.57 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2834  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.37 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0729  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0105  TraG  30.66 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2481  Ais protein  36.13 
 
 		 201 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2536  Ais protein  36.13 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2524  Ais protein  36.13 
 
 		 201 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00891491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2432  Ais protein  36.13 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2640  aluminum-inducible protein  35.29 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2397  phosphoglycerate mutase family protein  34.86 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.671498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2406  phosphoglycerate mutase family protein  33.94 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2547  phosphoglycerate mutase family protein  33.94 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1397  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1406  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02137  hypothetical protein  33.94 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02178  hypothetical protein  33.94 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3393  phosphoglycerate mutase family protein  33.03 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0931  hypothetical protein  26.26 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.608254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  25.32 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  25.31 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  32.35 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  32.35 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  31.86 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  32.35 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  32.35 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  31.37 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  31.37 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  30.77 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>