213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4970 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  97.92 
 
 
192 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  74.48 
 
 
194 aa  287  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  73.82 
 
 
191 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  72.25 
 
 
192 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  71.73 
 
 
192 aa  277  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  74.35 
 
 
188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  74.87 
 
 
188 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  73.96 
 
 
188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  73.82 
 
 
188 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  71.2 
 
 
192 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.99 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.68 
 
 
191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.38 
 
 
183 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  55.38 
 
 
183 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.38 
 
 
183 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.38 
 
 
242 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.84 
 
 
183 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.84 
 
 
183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  54.3 
 
 
183 aa  187  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  54.84 
 
 
190 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  54.84 
 
 
190 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.84 
 
 
191 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.84 
 
 
191 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  54.84 
 
 
187 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  54.84 
 
 
190 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.84 
 
 
191 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
185 aa  184  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.76 
 
 
189 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  52.69 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.15 
 
 
184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.08 
 
 
187 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
188 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.58 
 
 
184 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
189 aa  174  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
191 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.48 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
202 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.88 
 
 
214 aa  170  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  50 
 
 
184 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  44.88 
 
 
214 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  52.15 
 
 
185 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
189 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.19 
 
 
196 aa  168  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
197 aa  167  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.66 
 
 
190 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.69 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  51.08 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.79 
 
 
191 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
198 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.64 
 
 
194 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
183 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.17 
 
 
185 aa  158  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
189 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
191 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.85 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.39 
 
 
190 aa  151  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  45.41 
 
 
184 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.15 
 
 
189 aa  148  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.39 
 
 
178 aa  147  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.21 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.13 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.43 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  47.73 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.13 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.65 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.5 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.97 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
190 aa  143  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.39 
 
 
191 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.99 
 
 
187 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.78 
 
 
191 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.17 
 
 
191 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.88 
 
 
190 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.31 
 
 
184 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.99 
 
 
179 aa  141  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.52 
 
 
185 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.16 
 
 
192 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.67 
 
 
195 aa  141  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.55 
 
 
173 aa  141  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.67 
 
 
195 aa  141  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.35 
 
 
192 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.92 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.93 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.78 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.55 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.24 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.92 
 
 
190 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.4 
 
 
197 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  44.44 
 
 
190 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.62 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>