23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4314 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  96.83 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  54.42 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  45.83 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  47.44 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  46.3 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  48.29 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  48.06 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  46.34 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  48.69 
 
 		 203 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  25.97 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 514 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  40.43 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0572  membrane protein-like  35.56 
 
 		 158 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.37 
 
 		 325 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  23.41 
 
 		 516 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.51 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.67 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  30.69 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.57 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4755  hypothetical protein  30.93 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  32.04 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>