19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4281 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  83.93 
 
 		 224 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  87.08 
 
 		 246 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  82.78 
 
 		 224 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  56.83 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  56.76 
 
 		 226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  54.67 
 
 		 217 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  51.72 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  53.57 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  49.53 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  49.07 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  26.42 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  24.32 
 
 		 514 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  30.19 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  31.73 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.73 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  30.63 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  22.22 
 
 		 516 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.75 
 
 		 257 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>