18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1709 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  37.72 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1796  hypothetical protein  38.79 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.207584  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  38.38 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  40.43 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.84 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  40.43 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.79 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.62 
 
 		 351 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0673  hypothetical protein  31 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  32.32 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.02 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  32.43 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  30.63 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  26.8 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  27.97 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>