16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1135 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  85.27 
 
 		 224 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  87.08 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  87.56 
 
 		 224 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  53.74 
 
 		 226 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  52.86 
 
 		 226 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  52.89 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  48.77 
 
 		 203 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  51.34 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  47.66 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  47.2 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  25.79 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  27.36 
 
 		 135 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 514 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  30.3 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  21.72 
 
 		 516 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>