18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0278 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  27.48 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  25.77 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  27.64 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  31.19 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  25.41 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  26.02 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  25.97 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  24.74 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  23.98 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  26 
 
 		 516 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 514 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00303  hypothetical protein  25.69 
 
 		 516 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2955  putative lipoprotein  23.4 
 
 		 339 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  27.47 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>